Le système immunitaire protège le système génital contre les virus, les bactéries et les cellules cancéreuses. Le lait maternel contient des anticorps (IgA).
Le système immunitaire reçoit du système génital
Les sécrétions acides du vagin empêchent la multiplication des bactéries; les hormones de reproduction peuvent jouer un rôle dans le fonctionnement de l'immunité. Durant la grossesse, l'embryon et le fœtus ne sont pas rejetés par le système immunitaire parce qu'ils échappent à sa surveillance.